Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Gm6155-201ENSMUST00000173735 341 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm20701-201ENSMUST00000176082 347 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm20826-201ENSMUST00000179256 758 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm26828-201ENSMUST00000180640 172 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Mir6344-201ENSMUST00000183462 104 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm29443-202ENSMUST00000190297 410 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37098-201ENSMUST00000192290 244 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37700-201ENSMUST00000192617 965 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37359-201ENSMUST00000195243 526 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm37836-201ENSMUST00000195875 175 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm30043-201ENSMUST00000196689 733 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 4930443G03Rik-201ENSMUST00000203475 1282 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr189-ps1-201ENSMUST00000205310 804 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps61-201ENSMUST00000207286 889 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm32916-203ENSMUST00000208033 789 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr489-ps1-201ENSMUST00000210404 967 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm45710-201ENSMUST00000212847 215 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 4930567H12Rik-204ENSMUST00000213085 801 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 AC137127.3-201ENSMUST00000213340 349 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm30676-201ENSMUST00000214000 1165 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 AC069561.4-201ENSMUST00000215291 572 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm30313-201ENSMUST00000216806 597 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm39348-202ENSMUST00000217239 375 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 AC079644.1-201ENSMUST00000220586 405 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm46996-201ENSMUST00000220924 408 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 AC115357.1-201ENSMUST00000227575 466 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Fhl5-201ENSMUST00000029922 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Trim38-201ENSMUST00000074067 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Dach2-204ENSMUST00000113380 2894 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr617-203ENSMUST00000216516 3083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Pbrm1-201ENSMUST00000022471 5871 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Vmn2r116-201ENSMUST00000164856 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr1262-202ENSMUST00000111508 6068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm9700-201ENSMUST00000193786 1617 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Ttn-202ENSMUST00000099980 16891 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 AC102431.1-201ENSMUST00000223773 1449 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr1268-ps1-201ENSMUST00000117787 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm44288-201ENSMUST00000205061 2795 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Hnmt-201ENSMUST00000051416 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Olfr676-204ENSMUST00000219602 2802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Zfy1-202ENSMUST00000189888 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
Opn1mwO35599 Gm16440-201ENSMUST00000100900 1089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm14688-201ENSMUST00000119169 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Amy2a1-201ENSMUST00000132353 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm14368-201ENSMUST00000145305 415 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm25913-201ENSMUST00000157617 135 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Zakit-201ENSMUST00000157677 308 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm23115-201ENSMUST00000158480 108 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm3043-201ENSMUST00000170639 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm8902-201ENSMUST00000174341 1096 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Opn1mwO35599 Mir6391-201ENSMUST00000184391 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
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Opn1mwO35599 Olfr738-201ENSMUST00000058972 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn1r202-201ENSMUST00000078642 909 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Snora52-201ENSMUST00000082732 137 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Defa-ps18-201ENSMUST00000098889 371 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Defb26-201ENSMUST00000099205 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Cnot6l-202ENSMUST00000113005 3170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm44562-201ENSMUST00000207194 1347 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm16070-202ENSMUST00000149914 2146 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Olfr351-203ENSMUST00000215137 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Ugt2b5-201ENSMUST00000067790 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Atp1b4-202ENSMUST00000115134 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Nlrp4a-202ENSMUST00000119386 3215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Vmn2r-ps102-201ENSMUST00000222577 2203 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Ceacam3-201ENSMUST00000108491 3261 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Gm37628-201ENSMUST00000194644 5440 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Arpp19-203ENSMUST00000166549 1747 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Dock10-205ENSMUST00000187774 6796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
Opn1mwO35599 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
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