Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 AC164315.1-201ENSMUST00000226452 708 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm5215-201ENSMUST00000054380 405 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr749-201ENSMUST00000074674 1016 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr625-ps1-201ENSMUST00000098195 966 ntAPPRIS P5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Plcb4-201ENSMUST00000035646 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr992-202ENSMUST00000213749 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Lin28b-201ENSMUST00000079390 5402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Fam46d-204ENSMUST00000167154 3004 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Pds5b-203ENSMUST00000110486 2900 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Scml2-203ENSMUST00000077375 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gprc6a-203ENSMUST00000219286 2574 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm21119-201ENSMUST00000178438 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Hfm1-202ENSMUST00000117588 4870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm42598-201ENSMUST00000200110 2437 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm17101-201ENSMUST00000169520 1588 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 B230334C09Rik-201ENSMUST00000200255 8927 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Ccser2-201ENSMUST00000067700 7334 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Zfp11-201ENSMUST00000049778 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr824-202ENSMUST00000214192 3862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm44532-201ENSMUST00000207723 2598 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm26067-201ENSMUST00000103789 110 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr328-202ENSMUST00000108824 1199 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr1146-ps1-201ENSMUST00000117180 943 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Fabp12-202ENSMUST00000117917 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm15421-202ENSMUST00000118224 399 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm7189-201ENSMUST00000119811 429 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm13489-201ENSMUST00000121234 971 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm22106-201ENSMUST00000122544 127 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gtsf1-205ENSMUST00000141364 700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm3182-202ENSMUST00000169364 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Cldn34c1-206ENSMUST00000169445 705 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm7876-201ENSMUST00000169465 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm6337-202ENSMUST00000170613 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 4930461G14Rik-201ENSMUST00000181967 843 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Mir7235-201ENSMUST00000183796 56 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm29522-201ENSMUST00000191530 621 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Ighv1-3-201ENSMUST00000192764 302 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm43491-201ENSMUST00000197133 784 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm43724-201ENSMUST00000197516 226 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 1700011C11Rik-201ENSMUST00000205268 365 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm45032-201ENSMUST00000205375 520 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm36633-201ENSMUST00000205873 647 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 AC153800.1-201ENSMUST00000219212 365 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm46430-203ENSMUST00000221389 1049 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 9530050K03Rik-201ENSMUST00000221663 1299 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm17915-201ENSMUST00000222077 548 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Ly6e-ps1-201ENSMUST00000222501 367 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 AC080021.1-201ENSMUST00000228104 700 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Cst9-201ENSMUST00000028935 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Fam183b-201ENSMUST00000060581 493 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Mir28a-201ENSMUST00000083560 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm23796-201ENSMUST00000084011 160 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 1700057G04Rik-201ENSMUST00000098477 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Rbm41-203ENSMUST00000113007 3691 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 AC126439.1-201ENSMUST00000226772 2104 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Syne2-201ENSMUST00000044217 21690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm42946-201ENSMUST00000196108 2570 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Xrn1-202ENSMUST00000185633 10256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Vmn1r66-201ENSMUST00000060374 1524 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm37527-201ENSMUST00000192406 3547 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Tmem71-201ENSMUST00000048372 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr1270-202ENSMUST00000213946 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Pdc-202ENSMUST00000185698 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Zfp101-204ENSMUST00000174512 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 AL589737.1-201ENSMUST00000221163 2763 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm13310-201ENSMUST00000120962 1381 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr183-203ENSMUST00000213465 2200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr183-205ENSMUST00000214916 2249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm37569-201ENSMUST00000192111 1722 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Olfr3-201ENSMUST00000100151 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm14393-202ENSMUST00000109066 564 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm9427-201ENSMUST00000116187 651 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Spin2-ps1-201ENSMUST00000116643 875 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm11822-201ENSMUST00000119177 415 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm16179-201ENSMUST00000120685 373 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm13867-201ENSMUST00000120844 395 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm14603-201ENSMUST00000121275 448 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm3757-201ENSMUST00000125878 675 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm12609-201ENSMUST00000129908 610 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Bloc1s1-202ENSMUST00000131271 475 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
Rpl28P41105 Gm16254-201ENSMUST00000131528 730 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.4 ms