Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP8

Vmn1r10, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r10W4VSP8 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vmn1r10W4VSP8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Vmn1r10W4VSP8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms