Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2S7

Tsc22d3, TSC22 domain family protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsc22d3Q9Z2S7 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tsc22d3Q9Z2S7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tsc22d3Q9Z2S7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms