Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2B9

Rps6ka4, Ribosomal protein S6 kinase alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rps6ka4Q9Z2B9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rps6ka4Q9Z2B9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms