Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cldn6Q9Z262 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cldn6Q9Z262 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms