Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z238

Ccne2, G1/S-specific cyclin-E2, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccne2Q9Z238 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ccne2Q9Z238 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Ccne2Q9Z238 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Ccne2Q9Z238 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms