Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z179

Shcbp1, SHC SH2 domain-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shcbp1Q9Z179 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Shcbp1Q9Z179 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Shcbp1Q9Z179 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms