Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z160

Cog1, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog1Q9Z160 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cog1Q9Z160 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cog1Q9Z160 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms