Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0S4

Cldn13, Claudin-13, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn13Q9Z0S4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cldn13Q9Z0S4 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cldn13Q9Z0S4 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms