Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx1Q9WV80 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx1Q9WV80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms