Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTN0

Ggps1, Geranylgeranyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggps1Q9WTN0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ggps1Q9WTN0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms