Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Sema6cQ9WTM3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Sema6cQ9WTM3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms