Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Irx4Q9QY61 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Irx4Q9QY61 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms