Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXW4

Fscn3, Fascin-3, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fscn3Q9QXW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Fscn3Q9QXW4 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Fscn3Q9QXW4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms