Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Rad18Q9QXK2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Rad18Q9QXK2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms