Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG2

Chm, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmQ9QXG2 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ChmQ9QXG2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ChmQ9QXG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms