Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM9

Psma6, Proteasome subunit alpha type-6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma6Q9QUM9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Psma6Q9QUM9 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Psma6Q9QUM9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms