Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV5

Cul3, Cullin-3, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul3Q9JLV5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Cul3Q9JLV5 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cul3Q9JLV5 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms