Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLG4

Pkd2l2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Pkd2l2Q9JLG4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pkd2l2Q9JLG4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms