Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
CubnQ9JLB4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
CubnQ9JLB4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms