Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKY0

Cnot9, CCR4-NOT transcription complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot9Q9JKY0 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cnot9Q9JKY0 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cnot9Q9JKY0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms