Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Chrac1Q9JKP8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Chrac1Q9JKP8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms