Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
AtrQ9JKK8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.7□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
AtrQ9JKK8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms