Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Mrpl39Q9JKF7 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mrpl39Q9JKF7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms