Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Ctnnbip1Q9JJN6 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms