Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN4

Oxct2a, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 2A, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oxct2aQ9JJN4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Oxct2aQ9JJN4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Oxct2aQ9JJN4 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms