Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc86Q9JJ89 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc86Q9JJ89 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms