Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIT0

Lmbr1, Limb region 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1Q9JIT0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lmbr1Q9JIT0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Lmbr1Q9JIT0 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms