Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc22Q9JIG7 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 128.6 ms