Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ropn1Q9ESG2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ropn1Q9ESG2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms