Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Slc28a3Q9ERH8 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Slc28a3Q9ERH8 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms