Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Snap29Q9ERB0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Snap29Q9ERB0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms