Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Dap3Q9ER88 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Dap3Q9ER88 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms