Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Clstn2Q9ER65 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Clstn2Q9ER65 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms