Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Capn12Q9ER56 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Capn12Q9ER56 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms