Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ47

Vmn1r44, Vomeronasal type-1 receptor 44, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r44Q9EQ47 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Vmn1r44Q9EQ47 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Vmn1r44Q9EQ47 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms