Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL6

Mmp1b, Interstitial collagenase B, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp1bQ9EPL6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Mmp1bQ9EPL6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Mmp1bQ9EPL6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms