Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rnft1Q9DCN7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rnft1Q9DCN7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms