Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC3

Ccdc107, Coiled-coil domain-containing protein 107, mousemouse

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc107Q9DCC3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc107Q9DCC3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc107Q9DCC3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms