Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR1

Cmtm2a, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2aQ9DAR1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cmtm2aQ9DAR1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Cmtm2aQ9DAR1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.9 ms