Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Actrt1Q9D9J3 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Actrt1Q9D9J3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms