Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9D5

Tmco5a, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5A, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmco5aQ9D9D5 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Tmco5aQ9D9D5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmco5aQ9D9D5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms