Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gtf3c6Q9D8P7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms