Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Alkbh4Q9D8F1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Alkbh4Q9D8F1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms