Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl8cQ9D6I0 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
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Rtl8cQ9D6I0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Rtl8cQ9D6I0 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Rtl8cQ9D6I0 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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