Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PudpQ9D5U5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PudpQ9D5U5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms