Protein–RNA interactions for Protein: Q9D549

4930513O06Rik, RIKEN cDNA 4930513O06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930513O06RikQ9D549 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930513O06RikQ9D549 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms