Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C9

Clvs1, Clavesin-1, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clvs1Q9D4C9 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Clvs1Q9D4C9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Clvs1Q9D4C9 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms