Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
4933428M09RikQ9D3X3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms